离子束诱变育种与传统的辐射法及化学诱变剂相比，具有损伤轻、突变率高、突变谱广、遗传相对稳定，易于获得理想的新品(菌)种等特点，对品种的选育是较理想的方法。和传统的杂交育种相比，具有育种周期短、突变易稳定等优点。因此，具有广阔的应用前景。
中国科学院近代物理研究所从上世纪90年代开始利用兰州重离子研究装置提供的重离子束进行多种作物辐射诱变工作，在甜高粱、小麦、玉米、水稻、大豆、中药材、花卉及各种蔬菜等作物的诱变育种研究中获得了一系列科技成果和作物新品种、大量稳定的有益突变株系。
利用重离子诱变育种技术，可以根据育种目标，对粮食作物、资源植物进行诱变改良，提高产量、抗逆性及重要代谢物的含量，选育出各种突变种质和新品种，解决人类在粮食安全、能源安全、环境保护等方面的困境，同时可带来一定的经济效益和社会效益。