专利详情

专利名称	基于支持向量机的剪接位点识别方法
申请号	CN201210572684.3	专利类型	发明专利
公开（公告）号	CN103902853A	公开（授权）日	2014.07.02
申请（专利权）人	中国科学院深圳先进技术研究院	发明（设计）人	魏丹;姜青山;魏彦杰
主分类号	G06F19/24(2011.01)I	IPC主分类号	G06F19/24(2011.01)I
专利有效期	基于支持向量机的剪接位点识别方法至基于支持向量机的剪接位点识别方法	法律状态	实质审查的生效
说明书摘要	本发明涉及一种基于支持向量机的剪接位点识别方法，包括：构建数据集，数据集包括训练数据集及测试数据集；提取训练数据集的剪接位点序列的特征向量，记为第一特征向量；提取训练数据集的剪接位点上游序列及下游序列的特征向量，记为第二特征向量；根据第一特征向量及第二特征向量选取所述训练数据集的特征向量，记为第三特征向量；根据第三特征向量，构建SVM分类器；根据分类器识别所述测试数据集的剪接位点。本发明采用训练数据集构建马尔可夫模型，用该模型参数将训练数据集及测试数据集转换成特征向量，并将该特征向量和剪接位点上、下游密码子使用偏性的特征向量，进行线性组合，以提取剪接位点邻近序列中更多信息，从而提高分类精度。